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정보제공 : ZEUS 장비활용종합포털(www.zeus.go.kr)
DNA서열분석기
DNA Sequence analyzer
| GBTP No. | - |
|---|---|
| NFEC등록번호 | NFEC-2018-07-244650 |
| I-tube등록번호 | - |
| 보유기관 | 농림축산검역본부 |
| 연락처 | 054-912-0775 |
| 대표번호 | - |
장비정보
| 모델명 | SeqStudio | 제작사 | Thermo Fisher Scientific |
|---|---|---|---|
| 취득일자 | 2018-06-28 | 취득금액 | 87,120,000원 |
| 표준분류 | 화합물전처리/분석장비 > > | 활용용도 | 시험 |
| 장비위치 |
경상북도 김천시 혁신8로 177 농림축산검역본부 동물위생연구동 F2층 201
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| 장비설명 |
1. 처음 폴리머 주입부터 마지막 결과보고 단계까지 사용자의 간섭이 필요 없는 자동화된 장비이다.
2. 4개의 모세관으로 되어 있어 샘플의 염기서열 또는 DNA 단편 시료분석이 가능하다. 3. 모세관과 온도 조절 시스템이 장착된 전기영동 시스템으로 기존의 방식보다 주입시료의 양을 줄이면서도 효율과 감도가 높다. 또한 사용자의 적용에 따라 모세관, 분리물질과 시약 등을 적용에 따라 손쉽게 교환 할 수 있다. 4. 데이터 결과 신호의 표준화 기능이 있어 시료와 실험 조건 및 환경 차이에 의해 발생되는 결과의 편차를 보정이 가능하다. 5. 사용하는 소모품 및 시약에 대해 잔량, 실험 가능한 횟수, 유효기간 등 자동 정보 전달 기술이 적용되어 결과에 문제가 발생할 경우 사용자가 손쉽게 문제 해결을 할 수 있도록 기본적인 정보를 제공 한다. 6. 한번에 6개의 형광물질 검출이 가능하여 DNA 단편 시료 분석 시 멀티플렉스로 다양한 사이즈의 절편을 한 번에 검출이 가능하다. 7. 생거 시퀀싱(리시퀀싱 NGS 확인, 유전자 서열의 삽입-결실, 이형접합체 검출, 마이너 변형 검출)과 단편분석 (초위성체 분석, MLPA™, SNaPshot™ 응용 프로그램과 호환되는 분석, 세포주 인증)에 응용할 수 있다. 이 외에도 사용자에 의해 다양한 실험 분석을 접목할 수 있다. 8. 96 well 플레이트는 물론 분석 시료의 수량에 따라 8-strip 튜브 사용이 가능하다. 9. 실험 원리가 동일한 기존의 장비와 시약 및 소프트웨어가 공동으로 사용 가능하다. |
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| 구성 및 기능 |
1)구성
-자동 유전자 분석기 1 sys -정보처리장치 1 set -염기서열분석용 소프트웨어 1 set -DNA 단편 분석용 소프트웨어 1 set -돌연변이 검출용 소프트웨어 1 set 2) 성능 (1) DNA 단편 분석을 위해 6 개의 형광 염료를 동시에 검출하고 분석이 가능하다. (2) 유전자 분석기 스타터 키트와 함께 제공되는 DNA 컨트롤 표준을 사용하여 다음과 같이 24시간에 걸쳐 수차례 무인 작동으로 각 실행 모듈에 대한 다음 사양을 충족시킨다. (2-1) Short Read Standard Sequencing -ShortSeq 실행 모듈을 통해 유전자 분석기는 QV 30 CRL *에서 최대 350bp의 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 192 샘플까지 48 회까지 가능하다. (2-2) Medium Read Standard Sequencing -MediumSeq 실행 모듈을 통해 유전자 분석기는 QV 30 CRL * (최대 500 bp) 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 32 샘플 (최대 128 샘플)까지 생성 할 수 있다. (2-3) Long Read Standard Sequencing -LongSeq 실행 모듈을 통해 유전자 분석기는 QV 20 CRL * (최대 800 bp)의 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 48 개 샘플에서 12 회까지 가능하다. (2-4) BDX Sequencing -ShortSeq_BDX 실행 모듈을 통해 유전자 분석기는 QV 30 CRL * (최대 350bp)의 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 172 개 샘플에서 43 회까지 가능하다. -MediumSeq_BDX 실행 모듈을 사용하면 유전자 분석기가 QV 30 CRL * (최대 500 bp)의 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 120 개 샘플에서 30 회까지 가능하다. -LongSeq_BDX 실행 모듈을 통해 유전자 분석기는 QV 30 CRL * (최대 700bp)의 시퀀스를 생성 할 수 있으며 샘플 처리량은 최대 48 개 샘플에서 12 회까지 가능하다. (3) 유전자 분석기 스타터 키트와 함께 제공되는 DNA 컨트롤 표준을 사용하여, 시스템은 다음과 같이 24 시간에 걸쳐 일회에서 수차례의 무인 작동으로 각 실행 모듈에 대한 다음 단편 분석 사양을 충족시킨다. (3-1) 해상도 범위 60 ~ 460 bp의 단편에 대한 DNA 크기 조정 -FragAnalysis 실행 모듈을 사용하면 동일한 모세 혈관 전체의 주어진 대립 유전자 크기에 대해 시스템은 표준 편차가 0.15 bp 미만으로 수행되고 샘플 처리량은 최대 32 샘플 (최대 128 개 샘플)로 수행 가능 하다. (3-2) 분해능 범위가 60 ~ 600 bp 인 큰 조각에 대한 DNA 크기 조정 -LongFragAnalysis 실행 모듈을 사용하면 같은 모의 모든 모세 혈관의 주어진 대립 유전자 크기에 대해 시스템이 표준 편차가 0.15 bp에서 460 개까지, 0.30 bp에서 461에서 800 개까지 가능하며 샘플 처리량은 최대 48 샘플까지 12 회까지 가능하다. (3-3) 해상도 범위 40-120에서 SNapShot ™ 키트의 DNA 크기 결정 -SNapShot 실행 모듈을 사용하면 동일한 모세 혈관 전체의 주어진 대립 유전자 크기에 대해 시스템이 0.50 bp 미만의 표준 편차로 수행 한다. 샘플 처리량은 최대 230 샘플까지 58 회 실행된다. |
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| 사용/활용예 | |||
| 이용안내 | |||
| 유의사항 | |||
이용료안내
| 담당자에게 문의하시기 바랍니다. |
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